Lingkaran pita warna merah melambangkan bahwa Yayasan harus berani untuk berbuat sesuatu dan harus bermanfaat bagi seluruh warga dunia baik yang di belahan barat maupun timur atau melintas seluruh dunia sehingga terjadi keseimbangan nilai universal dilambangkan bintang kiri dan kanan.
Yayasan ini berlandaskan prinsip ketaatan dalam beribadah kepada Sang Pencipta Allah Yang Maha Kuasa, mencerminkan sikap religius dalam setiap proses pengambilan keputusan sehingga terdapat keteguhan antara ucap dan langkah.
Gambar motif batik mencirikan bahwa Yayasan memiliki dan menghargai nilai budaya dan kearifan lokal yang dimiliki bangsa Indonesia, serta dapat pula direpresentasikan sebagai bangsa atau umat yang rahmatan lil’alamin.
YAYASAN MERAH PUTIH JAYA SAKTI adalah nama yayasan yang dipilih oleh para pendiri dengan arti bahwa merah putih merupakan bendera kebangsaan Indonesia dan telah menjadi lambang sejak jaman kerajaan di Nusantara sebagai lambang kebesaran, kewujudan dan kedaulatan suatu wilayah negara. Merah berarti berani dan putih berarti suci atau kemurnian jiwa. Sedangkan Jaya Sakti melambangkan manusia yang memiliki keteguhan jiwa, serta dilengkapi dengan kepintaran atas ilmu pengetahuan yang dimilikinya.
Gambar Perisai merupakan lambang perjuangan dan perlindungan dari serangan musuh. Perisai selain melambangkan Indonesia yang selalu memegang teguh dasar negara Pancasila, UUD 1945, Bhinneka Tunggal Ika dan menjaga keutuhan NKRI, diartikan juga memiliki nilai spiritual yang akan menjadi benteng dan pelindung setiap aktivitas yayasan.
Gambar mahkota dapat diartikan sebagai simbol keinginan untuk mencapai keberhasilan dan kesuksesan tertinggi. Sebagai gambaran dari mahkota yang berkilauan dan bersinar, logo mahkota pada logo yayasan ini mencerminkan cita-cita untuk mencapai hal-hal yang luar biasa demi kepentingan bangsa dan negara.
Lima bintang di bagian atas logo yayasan dengan satu bintang yang paling atas. Bintang yang paling atas melambangkan Nabi Muhammad SAW dan empat bintang lainnya melambangkan empat sahabat Nabi. Selain itu masing-masing bintang melambangkan prinsip Ketuhanan Yang Maha Esa dan merupakan simbol dari semua agama dan memiliki arti kewenangan atau kesuksesan. Dalam kehidupan, sebisa mungkin yayasan tetap dapat memberikan cahaya atau manfaat bagi orang di sekitarnya.